PROCÉS D'EXTRACCIÓ DE PROTEÏNES
Extracció de proteïnes de Dunaliella salina
L'extracció de Dunaliella salina es du a terme quan s'assoleix la fase estacionaria del cultiu. Es monitoritza el creixement per comptatge cel·lular i quan pràcticament no hi ha creixement o la població d'algues comença a disminuir, es recol·lecten les cèl·lules per centrifugació.
Materials utilitzats
- Vasos de precipitats
- Bany d’ultrasons (Bandelin Sonorex Digiplus)
- Centrífuga (Hettich EBA 20)
- Tubs de centrífuga
- Microcentrífuga (Hettich MIKRO 120)
- Eppendorf
- Pipetes Pasteur 2 ml
- Micropipeta (Pipeta monocanal Handrop digital p1000)
- Puntes de micropipeta
- Tampó de lisi (NaCl 150 mM, Tris-Hydroxymethyl 50 mM, Tween 20 al 2%)
- Tampó d’EDTA 1x (TE)
- Acetona
- Cultiu d’algues de Dunaliella salina
- Bany amb gel i aigua
- Gradeta tubs centrífuga
- Gradeta eppendorf
Protocol d'extracció d'algues
Obtenció d'extracte per centrifugació
-
Centrifugar un volum determinat de cultiu d'algues en 2 tubs de centrífuga de 15 ml.
-
Afegir 10 ml i centrifugar durant 10 minuts a 6000 rpm.
-
Descartar el sobrenadant en un vas de precipitats.
-
Repetir els passos anteriors afegint 10 ml cada cop als mateixos tubs fins a centrifugar tot el volum de cultiu.
-
Congelar els tubs de centrífuga amb els extractes obtinguts (*)
-
Resuspendre pellet amb 500 µl de buffer de lisi. Si el pellet és molt gran i els 500 µl de buffer de lisi no són suficients per a separar el contingut del tub de centrífuga, afegir-hi també aigua de mar filtrada i traspassar les cèl·lules a diversos eppendorf amb l'ajuda d'una micropipeta p1000.
-
Centrifugar els eppendorfs en una microcentrífuga a 14000 rpm durant 10 minuts.
-
Descartar el sobrenedant.
-
Homogeneïtzar i resuspendre el pellet afegint 400 µl de buffer de lisi fred.
-
Congelar els eppendorf amb els extractes obtinguts (*)
Trencament de membrana plasmàtica per sonicació i congelació
-
Sonicar en bany d’ultrasons durant 20 segons (**).
-
Ràpidament posar en aigua i gel 20 segons.
-
Repetir els dos punts anteriors 2 vegades més.
-
Congelar 20 minuts.
-
Descongelar a temperatura ambient fins que la mostra es torni fluida.
-
Centrifugar a 14000 rpm durant 10 minuts.
-
Recuperar el sobrenedant a un eppendorf net prèviament retolat. Descartar el pellet.
Precipitació de proteïnes amb acetona
-
Afegir 4 volums d’acetona freda.
-
Congelar 15 minuts.
-
Descongelar a temperatura ambient fins que la mostra es torni fluida.
-
Centrifugar a 14000 rpm durant 20 minuts.
-
Descartar el sobrenedant.
-
Deixar evaporar l’acetona uns 2 minuts.
-
Resuspendre en 400 ul de buffer d’EDTA (TE) 1x.
(*) El procés d'extracció amb centrífugues de laboratori és llarg, el qual requereix de varis dies i de congelacions intermedies per a conservar les mostres. Caldrà descongelar les mostres a temperatura ambient abans de prosseguir almb el procés d'extracció.
(**) La sonicació s'utilitza de forma opcional en alguna de les mostres. Veure els resultats obtinguts a resultats i discussió